L'arcipelago è un raggruppamento di isole abbastanza vicine tra loro e spesso con caratteristiche morfologiche affini.

La Toscana ha sette isole dell'Arcipelago che sono: Elba, Capraia, Pianosa, Montecristo, Giglio, Giannutri, che si trovano nel  Mar Tirreno. Le isole sono diverse per l'origine geologica, ma diverse soprattutto per vicende storiche. Capraia è un'isola vulcanica, il Giglio e l'Elba sono formate da granito. La grande varietà geologica influenza la forma e paesaggio di ciascuna isola. Quando l'uomo ha vissuto nell'antichità,testimoniata dai ritrovamenti e dalla lunga tradizione di lavorazione dei minerali, ha prodotti profondi cambiamenti nella vegetazione originaria e i boschi di leccio restano solo in alcune zone dell'Elba, la macchia mediterranea ha sempre avuto tanta vegetazione. L'arcipelago Toscano ha rappresentato un importante area di rifugio e di collegamento tra il sistema sardo-corso e la penisola.